按国家卫生部消毒标准要求，湖南源生和清华大学对二氧化氯和液氯消毒进行共同实验鉴定，结果表明，二氧化氯对水中致病菌和非致病菌及微生物和病毒的杀灭效果都非常好，明显优于液氯，二氧化氯对水中的微球菌，葡萄球菌属，孢球放射菌属，八叠球菌属，芽孢杆菌属，短杆菌属，链霉菌属，无色杆菌属等这些非致病菌属有很好杀灭效果，同时，二氧化氯对水中的金黄色葡萄球菌，大肠杆菌，绿脓杆菌沙门氏菌，痢疾杆菌等致病菌具有很好的杀灭效果，而液氯的杀菌效果明显不如二氧化氯，另外，在PH值为3~9范围内都可很好的杀灭病菌，而液氯只有在近中性条件下（PH为6.5~8.5）可以有效杀灭病菌，相比液氯，二氧化氯投加量要少得多，二氧化氯的杀菌效果还可在水中持续很长时间，确保了管网里水的消毒效果。

液氯容易与水中有机物反应产生有机卤等致癌物，而二氧化氯不会与水中有机物质发生反应产生残留，所以，国际公认，二氧化氯取代液氯进行水消毒是必然趋势。